Spécialiste qualité étudiant

Le Centre de recherche Azrieli du CHU Sainte-Justine est à un stade de maturité qui lui a permis grâce à la recherche dexcellence qui sy réalise à travers la programmation scientifique de haut niveau dans ses créneaux mère-enfant de recevoir au cours de la dernière année des dons majeurs qui seront transformationnels et ouvriront dinnombrables perspectives pour la recherche en santé des enfants. Le Centre de recherche Azrieli du CHU Sainte-Justine réunit une équipe de plus de 1200 personnes soit plus de 295 chercheuses et chercheurs dont plus de 160 en recherche clinique et plus de 580 étudiantes et étudiants aux cycles supérieurs et stagiaires de recherche postdoctorale œuvrant dans des domaines dexpertise multiples. Projet

La plateforme dessert principalement les besoins des chercheurs en hémato-oncologie pédiatrique mais aussi dautres domaines et institutions pour répondre à leurs besoins en matière de technologies innovantes et danalyses avancées.

Cette plateforme est à la recherche dun biologiste computationnel hautement qualifié en bio-informatique dont le mandat principal sera dépauler les chercheurs dans leurs analyses de séquençage de génomes et de transcriptomes de troisième génération en temps réel notamment mais non exclusivement à partir des protocoles de type nanopores (e.g. Oxford Nanopore Technologies). Le candidat devra être apte à gérer le flux de données produites par la MPGI exécuter les flux de travail permettant le traitement de ces données en temps réel (durant le séquençage) et mener à terme différents types danalyses en lien avec les approches les plus courantes en (épi)génomique / (épi) plus le candidat recruté devra être capable de sadapter rapidement aux nouvelles technologies introduites par les équipes de recherches et pouvoir réaliser lanalyse dexpériences pilotes issues de technologies émergentes. Il devra aussi avoir dexcellentes qualités de communications puisquen concertation avec son équipe le titulaire sera amené à assister les chercheurs et le personnel de recherche pour des questions concernant un projet de recherche en lien avec le séquençage de type Nanopore.

Sous lautorité hiérarchique de la Cheffe des plateformes scientifiques et la supervision immédiate de la Responsable de plateforme en collaboration étroite avec le directeur scientifique de la plateforme le candidat aura de façon progressive et selon les projets priorisés différentes responsabilités :

Mener à terme des analyses matures à partir du traitement des données brutes de séquençage et optimiser le flux de traitement de données incluant documenter et communiquer le processus danalyse en temps réel les résultats les outils et les techniques utilisées. Conseiller les équipes de recherche à générer des données de type séquençage nanopore sur le design expérimental (consultation) en concertation avec son équipe;

Se familiariser avec les algorithmes et méthodes développées dans le volet cellules uniques single cell et participer aux projets lorsque requis;

Participer à la conception dexpériences (design expérimental) lanalyse de données et la résolution de problèmes techniques complexes;

Communiquer au client de manière efficace et en temps réel les résultats danalyses ou de contrôle de la qualité;

Organiser et hiérarchiser les données sur les serveurs (e.g. internes Calcul Québec ou Calcul Canada) en collaboration avec léquipe;

Participer à la mise en place dun système de gestion de linformation (SIL ou LIMS acronyme en anglais);

baccalauréat et plus de cinq années dexpérience).

Diplôme de troisième cycle ou postdoctoral un atout;

Expérience démontrée avec systèmes Unix/Linux et Git et avec des outils dintelligence artificielle;

Expérience avec les logiciels de gestion de projets de documentation du code et des activités relatives à la conservation des données et les outils de conteneurisation (Docker Kubernetes ou autre);

Bonne compétence en Data management ;

Maîtrise du français et de langlais parlé et écrit en milieu de travail.

Maîtrise du français et de langlais

Il sagit dun poste à temps complet (35 hrs/sem) non syndiqué (période de probation dun an). Tout permis de travail ayant la condition suivante ne sera pas éligible : Pas autorisé à exercer un emploi relié aux soins des enfants à lenseignement au primaire ou au secondaire au domaine de la santé .

Si ce poste vous intéresse veuillez utiliser notre site de recrutement pour postuler en ligne et soumettre votre CV.

Plan de vacances avantageux

• 20 jours de vacances par année pour le personnel
• Congé de maternité de paternité et dadoption

Régime de retraite à prestations déterminées (RREGOP)

Centre de la petite enfance Sainte-Justine

Service alimentaire qui encourage lagriculture biologique et locale

Le CHU Sainte-Justine souscrit au principe daccès à légalité en emploi et invite les femmes les membres des minorités visibles et des minorités ethniques les personnes handicapées et les Autochtones à poser leur candidature. Nous vous serions gré de nous faire part de tout handicap qui nécessiterait un aménagement technique et physique adapté à votre situation lors du processus de sélection.